Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC4Q9Y296 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms