Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED23Q9ULK4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms