Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENND2AQ9ULE3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENND2AQ9ULE3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms