Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMFRQ9UKV5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms