Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HCN3Q9P1Z3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms