Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms