Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DEPPQ9NTK1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEPPQ9NTK1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms