Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4BQ9NT99 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms