Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ANKRD66-202ENST00000565422 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CLEC12B-201ENST00000338896 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RPL6P8-201ENST00000490136 843 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AP006222.1-201ENST00000442116 1292 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ZRANB2-AS2-205ENST00000455406 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms