Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms