Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCGF6Q9BYE7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms