Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP2Q9BX26 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms