Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms