Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTKNQ9BST9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms