Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms