Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ZBED3Q96IU2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ZBED3Q96IU2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ZBED3Q96IU2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED3Q96IU2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ZBED3Q96IU2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ZBED3Q96IU2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ZBED3Q96IU2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ZBED3Q96IU2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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