Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINGO1Q96FE5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINGO1Q96FE5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms