Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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