Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZNF428Q96B54 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF428Q96B54 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms