Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6Q969F1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms