Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPBP1Q92547 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOPBP1Q92547 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms