Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC21AQ8NDW8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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