Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPC24Q8NBT2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms