Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms