Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALYREFQ86V81 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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