Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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