Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT27Q7Z3Y8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms