Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP31Q70CQ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP31Q70CQ4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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