Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HACD2Q6Y1H2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms