Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A13Q5J8X5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A13Q5J8X5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A13Q5J8X5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A13Q5J8X5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A13Q5J8X5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms