Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC153Q494R4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms