Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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RTN1Q16799 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RTN1Q16799 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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