Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME3Q16798 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ME3Q16798 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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