Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK4Q16654 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms