Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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