Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK5Q16478 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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