Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK4Q16099 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms