Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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