Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRKQ15262 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRKQ15262 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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