Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms