Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms