Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTAN1Q13813 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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