Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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