Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDH18Q13634 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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