Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC1Q13547 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC1Q13547 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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