Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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