Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPA4Q13156 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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