Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms