Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms