Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRMPQ12912 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms